我市农业种质资源主要为龟鳖类水产种质资源，常见有凭祥石龟、金钱龟、安南龟、火焰龟、山瑞鳖、黄沙鳖等，其中凭祥石龟为我市特有品种，是广西黄喉拟水龟中具有典型特征的石龟品种，同时也是国家农产品地理标志。截止2021年6月，我市登记在册的龟鳖养殖户108户，龟鳖养殖总量约24万只（其中黄喉拟水龟16万只，山瑞鳖3.5万只，安南龟1.6万只，其他种类2.9万只），较去年同期持平。凭祥水产技术推广站珍稀龟场养殖凭祥石龟2500多只，种龟种龄达到40年以上。全市各养殖大户种龟龟龄在30-40年的约4万只。凭祥龟鳖庭院生态养殖技术全覆盖，养殖户存种龟1000只以上的有惠明现代农业发展有限公司、凭祥市兴旺养殖场等近30家养殖场，与去年同期持平。2021年上半年龟鳖产量30吨，受新冠疫情禁野影响，养殖量较去年同期相比下降2%。

　　2021年以来我市继续狠抓种质资源保护和利用工作，指导凭祥市合展生态农业发展有限公司（华夏龟谷）和广西凭祥永祥龟鳖养殖场2家企业继续从事龟鳖产品深加工。华夏龟谷从事精深加工产品主要有龟苓膏、三龟酒、金龟多维纯元粉、金龟小分子浓缩液等保健产品；永祥龟鳖养殖场从事精深加工产品主要有龟苓膏、金龟酒（金钱龟酒）、凭祥石金钱龟酒（石龟酒）等，当前产值约511万元。